На север, река Харлем разделя остров Манхатън от Бронкс и континенталната част на САЩ. Няколко малки острови също са част от квартал на Манхатън, включително остров Рандъл, Wards остров и остров Рузвелт в Ийст Ривър и управителите Айлънд и остров Либърти на юг в пристанището на Ню Йорк. Остров Манхатън е 22.7 квадратни мили (59 км 2) в района, 13,4 мили (21,6 км) дълги и 2.3 мили (3.7 км) широки, най-широко (в близост до 14-та улица).
Манхатън е свободно разделени в Downtown (Долен Манхатън), Midtown (Манхатън) и Uptown (Горна Манхатън), с Пето Авеню се раздели източните и западните страни в Манхатън. Остров Манхатън граничи с река Хъдсън на запад и Ийст ривър на изток.
Основата в основата на голяма част от Манхатън е слюда шисти, известен като Манхатън шистовите. Той е силен, компетентен метаморфни скали създава, когато формира Пангея. Тя е много подходяща за основите на високи сгради и двата големи концентрации на небостъргачите на острова се срещат в места, където формирането е близо до повърхността. В Сентръл Парк, разкрития на Манхатън шистовите появят и Плъх Rock е един доста голям пример.